Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
TIMM17BO60830 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms