Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms