Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DNAJB11Q9UBS4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DNAJB11Q9UBS4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DNAJB11Q9UBS4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DNAJB11Q9UBS4 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DNAJB11Q9UBS4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DNAJB11Q9UBS4 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DNAJB11Q9UBS4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DNAJB11Q9UBS4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DNAJB11Q9UBS4 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms