Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IFT140Q96RY7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFT140Q96RY7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms