Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBGCP5Q96RT8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBGCP5Q96RT8 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBGCP5Q96RT8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TUBGCP5Q96RT8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TUBGCP5Q96RT8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms