Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RUFY3Q7L099 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms