Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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