Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P3H1Q32P28 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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