Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NDUFA9Q16795 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NDUFA9Q16795 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms