Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.175e-6■■■□□ 15.1
PCBP2Q15366 PUS7-204ENST00000481939 2436 ntTSL 516.66■□□□□ 0.264e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 04e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 PUS7-201ENST00000356362 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.744e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 SMG7-211ENST00000507406 582 ntTSL 33.75□□□□□ -1.814e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 TPM3-203ENST00000312970 750 ntTSL 57.51□□□□□ -1.218e-13■■■□□ 15
PCBP2Q15366 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.424e-7■■■□□ 15
PCBP2Q15366 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.251e-14■■■□□ 15
PCBP2Q15366 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-14■■■□□ 15
PCBP2Q15366 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.061e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 CYP4F11-205ENST00000620614 2908 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 MOCS1-209ENST00000487924 566 ntTSL 416.65■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 MOCS1-208ENST00000473742 591 ntTSL 415.29■□□□□ 0.041e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 15
PCBP2Q15366 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.112e-7■■■□□ 15
PCBP2Q15366 C19orf54-202ENST00000469741 1792 ntTSL 215.57■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 15
PCBP2Q15366 C19orf54-209ENST00000598485 553 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.652e-7■■■□□ 15
PCBP2Q15366 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.323e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 FAM208B-205ENST00000473789 506 ntTSL 522.4■■□□□ 1.181e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 FAM208B-210ENST00000496681 522 ntTSL 321.91■■□□□ 1.11e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 FAM208B-213ENST00000532424 433 ntTSL 319.27■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 317.97■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 215.73■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 FAM208B-204ENST00000463468 560 ntTSL 35.4□□□□□ -1.541e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 FAM208B-208ENST00000482419 424 ntTSL 25.3□□□□□ -1.561e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 PTBP1-209ENST00000586481 578 ntTSL 318.61■□□□□ 0.577e-7■■■□□ 15
PCBP2Q15366 PTBP1-216ENST00000590887 642 ntTSL 312.73□□□□□ -0.377e-7■■■□□ 15
PCBP2Q15366 PTBP1-214ENST00000589575 749 ntTSL 312.22□□□□□ -0.457e-7■■■□□ 15
PCBP2Q15366 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.253e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 TNK2-220ENST00000486523 300 ntTSL 319.47■□□□□ 0.714e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 TNK2-212ENST00000439230 2331 ntTSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.494e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 PCED1A-204ENST00000448755 1170 ntTSL 317.48■□□□□ 0.399e-12■■■□□ 15
PCBP2Q15366 EEF1D-208ENST00000524883 828 ntTSL 217.36■□□□□ 0.379e-12■■■□□ 15
PCBP2Q15366 PCED1A-203ENST00000439542 1187 ntTSL 214.97□□□□□ -0.019e-12■■■□□ 15
PCBP2Q15366 EEF1D-222ENST00000528519 553 ntTSL 314.9□□□□□ -0.029e-12■■■□□ 15
PCBP2Q15366 EEF1D-214ENST00000526135 535 ntTSL 212.06□□□□□ -0.489e-12■■■□□ 15
PCBP2Q15366 ASAP1-214ENST00000524124 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.56□□□□□ -1.364e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 AUP1-208ENST00000486234 984 ntTSL 512.58□□□□□ -0.46e-15■■■□□ 15
PCBP2Q15366 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 DNAJC5-202ENST00000470551 5287 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.893e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.613e-6■■■□□ 15
PCBP2Q15366 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.261e-12■■■□□ 15
PCBP2Q15366 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.258e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.018e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.028e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SWI5-202ENST00000372898 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 514.07□□□□□ -0.168e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.678e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SWI5-203ENST00000418976 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.698e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.521e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.521e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.431e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.41e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.251e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DDAH2-220ENST00000488119 1121 ntTSL 221.32■■□□□ 11e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.971e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC01881-207ENST00000622435 555 ntTSL 520.19■□□□□ 0.821e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 319.87■□□□□ 0.771e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.771e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC01881-204ENST00000444990 557 ntTSL 318.81■□□□□ 0.61e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.591e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.591e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 218.23■□□□□ 0.511e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DDAH2-218ENST00000480913 937 ntTSL 517.99■□□□□ 0.471e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 DDAH2-214ENST00000416410 887 ntTSL 217.97■□□□□ 0.471e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 EXD3-211ENST00000490886 1123 ntTSL 517.74■□□□□ 0.431e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MRPS6-202ENST00000477091 1061 ntTSL 516.62■□□□□ 0.251e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.251e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 VSIG10L-202ENST00000600663 2297 ntTSL 1 (best)16.5■□□□□ 0.231e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC01881-202ENST00000431796 565 ntTSL 416.2■□□□□ 0.181e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-207ENST00000634712 1388 ntTSL 514.79□□□□□ -0.041e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-209ENST00000635450 947 ntTSL 514.68□□□□□ -0.061e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.071e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 TACC2-218ENST00000492237 438 ntTSL 514.58□□□□□ -0.081e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 RAB11FIP1-205ENST00000523182 2329 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.121e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.131e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.141e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SUOX-209ENST00000550065 2511 ntTSL 513.36□□□□□ -0.271e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 TACC2-220ENST00000493951 645 ntTSL 513.31□□□□□ -0.281e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-211ENST00000641009 1450 nt12.88□□□□□ -0.351e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 SUOX-203ENST00000394109 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.41e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.461e-12■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-201ENST00000404210 1189 ntBASIC11.93□□□□□ -0.51e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.51e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-204ENST00000434233 929 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.51e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-203ENST00000420503 771 ntTSL 311.76□□□□□ -0.531e-7■■■□□ 14.9
PCBP2Q15366 LINC00339-206ENST00000634451 687 ntTSL 511.76□□□□□ -0.531e-7■■■□□ 14.9
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