Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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EFNB1P98172 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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EFNB1P98172 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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EFNB1P98172 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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EFNB1P98172 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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EFNB1P98172 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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EFNB1P98172 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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EFNB1P98172 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
EFNB1P98172 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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