Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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FAM3BP58499 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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FAM3BP58499 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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FAM3BP58499 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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FAM3BP58499 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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FAM3BP58499 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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FAM3BP58499 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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FAM3BP58499 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
FAM3BP58499 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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