Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARL4CP56559 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms