Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EPHB1P54762 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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