Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GDF5P43026 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GDF5P43026 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GDF5P43026 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms