Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FDFT1P37268 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms