Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EGR1P18146 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
EGR1P18146 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EGR1P18146 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
EGR1P18146 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EGR1P18146 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms