Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LTAP01374 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LTAP01374 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LTAP01374 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LTAP01374 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LTAP01374 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LTAP01374 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LTAP01374 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LTAP01374 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LTAP01374 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LTAP01374 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LTAP01374 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LTAP01374 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LTAP01374 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LTAP01374 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LTAP01374 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LTAP01374 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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LTAP01374 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LTAP01374 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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