Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PRAMEF25A6NGN4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF25A6NGN4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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