Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFMBT1Q9UHJ3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms