Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLIP2Q9UDT6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms