Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC17A6Q9P2U8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms