Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPR88Q9GZN0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms