Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCAPERQ9BY12 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCAPERQ9BY12 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms