Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms