Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HPS3Q969F9 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HPS3Q969F9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms