Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EDAQ92838 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EDAQ92838 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms