Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOBEC4Q8WW27 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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