Protein–RNA interactions for Protein: Q12882

DPYD, Dihydropyrimidine dehydrogenase [NADP(+)], humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPYDQ12882 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DPYDQ12882 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DPYDQ12882 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms