Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPIBQ01892 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms