Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IFITM3Q01628 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms