Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVK-24P63145 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVK-24P63145 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms