Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GCAP28676 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GCAP28676 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GCAP28676 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms