Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GABRB3P28472 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms