Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTLA4P16410 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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