Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL3O43909 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL3O43909 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL3O43909 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL3O43909 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXTL3O43909 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EXTL3O43909 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms