Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOC4-APOC2K7ER74 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
APOC4-APOC2K7ER74 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms