Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PRDM5Q9NQX1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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