Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HDAC8Q9BY41 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.7 ms