Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C1orf50Q9BV19 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf50Q9BV19 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C1orf50Q9BV19 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms