Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
CHCHD7Q9BUK0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CHCHD7Q9BUK0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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