Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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MCOLN3Q8TDD5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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MCOLN3Q8TDD5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3Q8TDD5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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