Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC112Q8NEF3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC112Q8NEF3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms