Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL8

Putative uncharacterized protein FLJ42384, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZVL8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q6ZVL8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms