Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CDK5R1Q15078 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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CDK5R1Q15078 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CDK5R1Q15078 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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