Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PMS2P11Q13670 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms