Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
FOXE3Q13461 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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