Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE3BQ13370 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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