Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BNIP3Q12983 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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