Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGEF5Q12774 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms